- 門診服務: 一般門診、健兒門診、預防注射、特約門診 (兒童關懷門診、營養發育評估門診)、潛伏結核感染評估及治療 、青少年親善門診
- 病房服務: 一般疾病住院照顧、新生兒照顧、早產兒照顧、兒童加護病房照顧
- 檢查服務: 腦部超音波、腹部超音波、腎臟超音波、心臟超音波、髖關節超音波、腦電波檢查、 胃鏡檢查、大腸鏡檢查
- 公衛服務: 兒童家庭責任醫師、學童健檢、校園疫苗注射
- 兒少關懷門診: 由小兒神經科醫師與兒童心智科醫師共同看診, 主要服務對象為發展遲緩、學習困難、情緒障礙、注意力不足過動症、抽動症或妥瑞症等等兒童神經及精神疾病
- 營養發育評估門診: 由小兒腸胃科與營養師共同看診, 主要服務對象為體重過輕、偏挑食、身材矮小、體重過重等病童
- 特殊檢查: 本科是少數區域醫院中能執行兒童及青少年胃鏡與 大腸鏡檢查的小兒科，服務對象為胃潰瘍、十二指腸潰瘍、 消化道出血、息肉及腸胃發炎性疾病之患童
- 兒童家庭責任醫師制度: 本科為提供育兒家庭更多的育兒資訊，會定期到加入本計畫之兒童家中訪視，提供居家照顧服務，收案條件如下:
(1) 新生兒收案: 只要在本院區出生的新生兒皆可加入
(2) 門診收案: 只要來本院區兒科門診看診之3歲以下幼兒皆可加入
(3) 高風險家庭收案: 由台北市衛生局轉介之高風險家庭中3歲以下兒童
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